Pak-key和欢喜与天堂交涉期间却遭天堂设计，泰国警方以贩毒的罪名人赃并获拘捕。

　　卓凯和淑梅陆续确认了乐少锋和徐天堂的卧底身份。为了尽快寻回其他卧底，卓凯更亲自潜入长兴，遇到专门替德信处理黑钱生意的施嘉莉，从而更深入发现犯罪世界的另一面。

　　欢喜与德信的斗争，将卓凯和众卧底卷入其中，为对付德信以及他操控的黑警势力，卓凯及众卧底不得不与欢喜联手。

　　旺角警署陆SIR发现警队接连发生高层警官被杀事件。卓凯及淑梅同时发现，这一切可能是少锋所为，少锋身份就被德信发现，落得惨死收场……

　　长兴与福和斗争白热化，双方牵涉入一宗国际犯罪集团的洗黑钱活动当中，德信使计令欢喜一败涂地，但同时他所有黑钱一夜之间不翼而飞。

　　各地犯罪集团首脑纷纷来港向德信问责。卓凯布下天罗地网，准备把各地犯罪首脑一网打尽。德信拼死反扑，卓凯、淑梅、欢喜、天堂等都被列入“必杀”名单，到底他们最后能否逃过一劫?据了解，在《使徒行者2》中，徐天堂结局并没有死，并和同伴们继续了他的卧底身份。

　　作为《使徒行者》的前传，CIB高级督察卓sir(苗侨伟饰)成为了《使徒行者2》中的灵魂人物。在今日曝光的终极版片花中，为了不让香港成为国际黑钱的转口港，卓sir潜入香港最大势力集团“长兴”，掌握了主动权。

　　而此时，“长兴”的头领魏德信(陈豪饰)与他的得力助手施嘉莉(宣萱饰)也正在为这笔黑钱能够顺利入港而周旋。

　　正邪势力紧张博弈的同时，卓sir假借辞职之机，与菜鸟卧底阿梅(黄翠如饰)联手，开始寻找失散的卧底，试图揪出潜伏在警局的幕后黑手，《使徒行者2》的故事也就此展开。

　　卓sir与丫头(阿梅)在执行任务的过程中，与处事潇洒的花花公子徐天堂(袁伟豪饰)、外冷内热的打手乐少锋(周柏豪饰)等关键人物多次交手。他们的真实身份究竟是什么，等待观众们到剧集中去寻找答案。

　　而另一边，欢喜哥(许绍雄饰)所创立的香港另一势力集团“福和”，处处与“长兴”针对，明争暗斗毫不相让。而欢喜哥的真实身份也将在《使徒行者2》中被揭开。